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王淦昌始终坚持实验原则，尤其是对于宇宙线的实验，他认为实验一定要用径迹探测手段得到确实的证据，这样多年后的科研工作者还可以进一步开展复核检验等工作。
20世纪中期，苏联科学家在帕米尔高原上建立了一个宇宙线实验站。两位苏联科学院院士设计了一套电子系统，每当有粒子进入时，系统就会产生相应的电信号。不久，他们便宣布利用这套系统发现了十多个新粒子，并将其命名为“变子”。王淦昌研究后评价：电信号的重复性不好确定，仅凭一个电信号就断言新发现粒子有些草率。之后，其他科学家在更精密的实验条件下，进行了一系列实验，但都没有找到一个所谓的“变子”。最后证明，王淦昌的评价是正确的。
何祚庥院士在回忆时说道：“这件事当时在我的心灵上引起的震动是巨大的。我一是惊讶苏联人居然也有不成功的事情，二是从心眼里佩服王老敏锐的科学洞察力。在那时的政治背景下，王老对苏联科学家的直言批评，充分体现了他追求真理、崇尚实践的勇气和科学精神。”
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